More

    Ταυτοποίηση μιας νέας ομάδας του ιού SARS-CoV-2 στο Ηνωμένο Βασίλειο με μεγάλο αριθμό μεταλλαγών στην εξωτερική πρωτεΐνη – spike

    Ο ιός SARS-CoV-2 ενσωματώνει, όπως οι περισσότεροι ιοί,συνεχώς μεταλλαγές στο γονιδίωμα του και η εμφάνιση νέων γενετικά στελεχών αποτελεί μια αναμενόμενη διαδικασία.

    Στην αναφορά με τίτλο: Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations από τους Andrew Rambaut, Nick Loman, Oliver Pybus, Wendy Barclay, Jeff Barrett, AlesandroCarabelli, Tom Connor, Tom Peacock, David L Robertson, Erik Volz, on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK (CoG-UK) δημοσιεύεται η ανάλυση και τα χαρακτηριστικάμιας νέας ομάδας (B.1.1.7) του κορωνοϊού SARs-CoV-2. Hβιβλιογραφία ανασκοπείται από τους Καθηγητές της Ιατρικής του ΕΚΠΑ Δημήτριο Παρασκευή (Αναπληρωτής Καθηγητής Επιδημιολογίας και Προληπτικής Ιατρικής) και Θάνο Δημόπουλο (Πρύτανης ΕΚΠΑ).

    Από γενετική ανάλυση του γονιδιώματος του νέου κορωνοϊού ταυτοποιήθηκε πρόσφατα στο Ηνωμένο Βασίλειο μια ξεχωριστή φυλογενετική ομάδα του ιού SARS-CoV-2 που ονομάστηκε B.1.1.7. Σε διάστημα των τελευταίων 4 εβδομάδων στελέχη αυτής της ομάδας έχουν εξαπλωθεί εκτεταμένα στο Ηνωμένο Βασίλειο.

    Μερικά χαρακτηριστικά αυτής της ομάδας είναι αξιοσημείωτα και σημειώνονται παρακάτω:

    Η ομάδα B.1.1.7 αντιπροσωπεύει ένα αυξανόμενο ποσοστό περιστατικών σε διαφορετικές περιοχές της Αγγλίας. Ο αριθμός των κρουσμάτων Β.1.1.7 και ο αριθμός των περιοχών που αναφέρονται μεταδόσεις με στελέχη Β.1.1.7 αυξάνονται διαρκώς.

    Τα στελέχη της ομάδας Β.1.1.7 έχουν ασυνήθιστα υψηλό αριθμό μεταλλαγών ιδιαίτερα στην περιοχή της εξωτερικής πρωτεΐνης (spike).

    Oι μεταλλαγές της ομάδας συνοψίζονται στον παρακάτω Πίνακα:

    • Γονίδιο
    • Νουκλεοτιδική θέση
    • Αμινοξύ
    • ORF1ab
    • C3267T
    • T1001I
    • C5388A
    • A1708D
    • T6954C
    • I2230T
    • 11288-11296 διαγραφή (deletion)
    • SGF 3675-3677 deletion
    • Εξωτερική πρωτεΐνη (spike)
    • 21765-21770 διαγραφή(deletion)
    • HV 69-70 διαγραφή(deletion)21991-21993 διαγραφή(deletion)
    • Y144 διαγραφή(deletion)
    • A23063T
    • N501YC23271A
    • A570DC23604A
    • P681HC23709T
    • T716IT24506G
    • S982AG24914C
    • D1118H
    • Orf8
    • C27972T
    • Q27stop
    • G28048T
    • R52I
    • A28111G
    • Y73C
    • N 28280 GAT->CTA
    • D3L
    • C28977T
    • S235F

    Οι μεταλλαγές στην εξωτερική πρωτεΐνη (spike)περιλαμβάνουν τη θέση 501 (N501Y) που αφορά την περιοχή του ιού που αλληλεπιδρά με τον υποδοχέα (receptor bindingdomain, RBD) και πειραματικά δεδομένα υποδεικνύουν ότι αυξάνει την πρόσδεση με τον υποδοχέα ACE2. H μεταλλαγή P681H εντοπίζεται στο τμήμα που ανιχνεύεται από το ένζυμο φουρίνη μεταξύ των υποπεριοχών S1 και S2 του spike. Hπεριοχή αυτή που εντοπίζεται μόνο στον SARS-CoV-2 και όχι σε άλλους συγγενικούς κορωνοϊούς, και έχει βρεθεί ότι προάγει την μόλυνση των επιθηλιακών κύτταρων του αναπνευστικού. Η μεταλλαγή N501Y σχετίζεται με αυξημένη μολυσματικότητα του ιού σε πειραματόζωα.

    Παράλληλα έχει εντοπιστεί μια διαγραφή δύο αμινοξέων στις θέσεις 69-70 που συνήθως παρατηρείται σε στελέχη με μεταλλαγές στην περιοχή του ιού που αλληλεπιδρά με τον υποδοχέα (RBD).

    Τα στελέχη της ομάδας Β.1.1.7 περιλαμβάνουν έναν ασυνήθιστα μεγάλο αριθμό μεταλλαγών (14) σε σχέση με τον αναμενόμενο. Οι περισσότερες ομάδες μέχρις σήμερα σχετίζονται με μικρό αριθμό μεταλλαγών και η συχνότητα εμφάνισης τους είναι περίπου 1-2 μεταλλαγές το μήνα. Προκαταρκτική ανάλυση έδειξε ότι ο ρυθμός μοριακής εξέλιξης (ο ρυθμός δηλαδή μεταλλαγών) μέσα στην ομάδα Β1.1.7 είναι παρόμοιος με άλλες ομάδες του SARs-CoV-2.

    Συμπερασματικά η αναφορά περιγράφει μια νέα ομάδα που εξαπλώνεται ταχέως στο Ηνωμένο Βασίλειο και σχετίζεται με έναν απροσδόκητα μεγάλο αριθμό μεταλλαγών, συμπεριλαμβανομένης της περιοχής αλληλεπίδρασης με τον υποδοχέα του ιού στα κύτταρα στόχους και με την θέση αλληλεπίδρασης της φουρίνης. Λαμβάνοντας υπόψη (i) τις βιολογικές ιδιότητες αυτών των μεταλλαγών όπως προέκυψαν από πειραματικά δεδομένα, (ii) τις άγνωστες ιδιότητες του συνδυασμού αυτών των μεταλλαγών, και (iii) τον υψηλό ρυθμό διασποράς του Β.1.1.7 στο Ηνωμένο Βασίλειο, οι ιδιότητες αυτής της ομάδας χρήζουν άμεσης εργαστηριακής μελέτης και η περαιτέρω παρακολούθηση της διασποράς της ομάδας αυτής παγκοσμίως, είναι αναγκαία. Προς το παρόν η επίδραση αυτών των μεταλλαγών αναφορικά με τη νοσηρότητα, τη μολυσματικότητα ή τα αντιγονικά χαρακτηριστικά του ιού που σχετίζονται με τον εμβολιασμό, είναι υπό διερεύνηση.

    ΔΙΑΒΑΣΤΕ ΕΠΙΣΗΣ 

    Γιορτές με lockdown: Ο χειρότερος συνδυασμός για τους ασθενείς με διαβήτη

    «Έχει απομονωθεί και στην Ελλάδα» η νέα μετάλλαξη του κορωνοϊού

    Ακολουθήστε μας στο Google News και ενημερωθείτε πρώτοι για όλες τις ειδήσεις.

    ΔΙΑΒΑΣΤΕ ΑΚΟΜΗ

    Πρόσφατα Άρθρα

    Στην ΜΠΑΜ που κυκλοφορεί: Στα χέρια μας η ελευθερία

    Η εφημερίδα των μεγάλων αποκαλύψεων κυκλοφορεί με ρεπορτάζ που θα κάνουν «ΜΠΑΜ» και θα προκαλέσουν σεισμό! Μήνυση - Καταπέλτης: Βαρύ "κατηγορώ" από Νικόλα Στραβοπόδη...

    Λαμία: Ηλικιωμένη βρέθηκε τραυματισμένη σε ρέμα – Κατηγορεί άλλη γυναίκα ότι την κτύπησε και την έσπρωξε

    Όλα ξεκίνησαν νωρίς το απόγευμα του Σαββάτου όταν ένας κάτοικος του χωριού πήγε μαζι με το γιό του να ανάψει το καντήλι συγγενικού του...

    Πολιτική Προστασία: Παράταση καθολικού lockdown για μια εβδομάδα στην Κάλυμνο

    Την παράταση των των ειδικών περιοριστικών μέτρων με γενικό lockdown στην Κάλυμνο για μια εβδομάδα ανακοίνωσε η Γενική Γραμματεία Πολιτικής Προστασίας. Η ανακοίνωση Μετά από σύσκεψη...

    Σημεία μαζικών δειγματοληψιών από τις ΚΟΜΥ του ΕΟΔΥ την Κυριακή 16 Μαΐου

    Αύριο, Κυριακή 16 Μαΐου, Κινητές Ομάδες Υγείας (ΚΟΜΥ) του Εθνικού Οργανισμού Δημόσιας Υγείας (ΕΟΔΥ) θα βρίσκονται σε κεντρικά σημεία σε ολόκληρη την επικράτεια, όπου...

    Άλλη μία αυτοκτονία στην Κρήτη: Απαγχονίστηκε 28χρονος

    Σοκ προκαλούν στο Ηράκλειο τα απανωτά περιστατικά αυτοχειρίας, καθώς το βράδυ του Σαββάτου, απαγχονισμένος βρέθηκε στο εσωτερικό κτιρίου στο κέντρο της πόλης ένας νέος...